Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Taf13P61216 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Taf13P61216 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Taf13P61216 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Taf13P61216 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms