Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sem1P60897 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sem1P60897 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms