Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Eif3eP60229 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Eif3eP60229 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms