Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Tpm2P58774 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms