Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Setd4P58467 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Setd4P58467 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Setd4P58467 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms