Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtnsP57757 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtnsP57757 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms