Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CckbrP56481 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CckbrP56481 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CckbrP56481 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms