Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cdkn2bP55271 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cdkn2bP55271 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdkn2bP55271 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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