Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Aqp4P55088 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms