Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GemP55041 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GemP55041 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GemP55041 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GemP55041 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GemP55041 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GemP55041 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GemP55041 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GemP55041 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GemP55041 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GemP55041 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GemP55041 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms