Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Acod1P54987 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms