Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PitpnbP53811 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PitpnbP53811 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms