Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube2e3P52483 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms