Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psen1P49769 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psen1P49769 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms