Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prox1P48437 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms