Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sox2P48432 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox2P48432 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms