Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CratP47934 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CratP47934 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CratP47934 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CratP47934 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CratP47934 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms