Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scg3P47867 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms