Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pax7P47239 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pax7P47239 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms