Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gdf5P43027 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gdf5P43027 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms