Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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VhlP40338 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
VhlP40338 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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VhlP40338 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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VhlP40338 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
VhlP40338 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
VhlP40338 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
VhlP40338 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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