Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Csf3rP40223 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms