Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Traf2P39429 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms