Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtlP38585 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtlP38585 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtlP38585 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtlP38585 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TtlP38585 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TtlP38585 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms