Protein–RNA interactions for Protein: P35582

Foxa1, Hepatocyte nuclear factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxa1P35582 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Foxa1P35582 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms