Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rab23P35288 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab23P35288 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms