Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Saa4P31532 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Saa4P31532 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms