Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxa10P31310 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms