Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Hoxa2P31245 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa2P31245 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms