Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Casp2P29594 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Casp2P29594 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms