Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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Hoxd10P28359 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
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Hoxd10P28359 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxd10P28359 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Hoxd10P28359 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Hoxd10P28359 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Hoxd10P28359 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxd10P28359 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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