Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gjb3P28231 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gjb3P28231 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms