Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjc1P28229 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjc1P28229 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms