Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psmb9P28076 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psmb9P28076 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms