Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vav1P27870 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vav1P27870 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms