Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rpl3P27659 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl3P27659 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms