Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd40lgP27548 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd40lgP27548 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms