Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PdgfraP26618 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PdgfraP26618 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms