Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctnna1P26231 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms