Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UbtfP25976 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms