Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NdnP25233 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NdnP25233 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NdnP25233 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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