Protein–RNA interactions for Protein: P22907

Hmbs, Porphobilinogen deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmbsP22907 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HmbsP22907 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HmbsP22907 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms