Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tap1P21958 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tap1P21958 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms