Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Fcer1aP20489 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Fcer1aP20489 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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