Protein–RNA interactions for Protein: P20443

Sag, S-arrestin, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SagP20443 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SagP20443 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SagP20443 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SagP20443 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SagP20443 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SagP20443 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SagP20443 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SagP20443 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms