Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cox5bP19536 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms