Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifrd1P19182 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifrd1P19182 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms