Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tnnc1P19123 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnc1P19123 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms