Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P18524 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18524 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18524 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P18524 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P18524 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P18524 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P18524 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P18524 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms