Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxb1P17919 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxb1P17919 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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